Рыбы занесенные в красную книгу Башкирии

Русский осетр (башк. Мәрсен, бикре) — вид осетровых отряда осетрообразных. Обитает в бассейнах Чёрного, Азовского и Каспийского морей. Численность вида катастрофически падает. В начале XX века обитал во всех крупных рек республики.
Европейский хариус (башк. Европа бәрҙеhе) — вид хариусовых отряда лососеобразных. Распространен от Европы до Урала, в России обитает в бассейнах Белого и Балтийского морей, отсутствует в бассейне Днепра, в Крыму, на Кавказе. В Башкортостане обитаетв бассейнах рек Белой, Уфы, Урала, отмечен в рекахСакмара, Большой и Малый Кизил, Инзер, Зилим, Ай, Большой Ик, Нура, Тирлян, Малый Нугуш, Миндяк, Уй, Юрюзань и многих небольших реках.

Стерлядь (башк. Уҡбалыҡ) — вид осетровых отряда осетрообразных. В России населяет бассейны Чёрного, Азовского, Каспийского, Балтийского морей и Северного ледовитого океана (на восток до Енисея). В Башкортостане стерлядь обитает в реке Белой (до города Мелеуза) и крупных притоках — рек Сим, Уршак, Уфа и Дёма.

Обыкновенный таймень (башк. Ҡыҙыл балыҡ) - вид лососевых отряда лососеобразных. Населяет большинство крупных рек Сибири и некоторые озера. В Башкортостане редко встречается в горных участках рек Белой, Сим, Инзер, Лемеза, Зилим, Зиган, Мендим, Большой Кухтур, Большой и Малый Шишеняк, Рязь, Басу, Курт, Большая Кургашка, Селеук, Ряузяк.

Ручьевая форель (башк. Йылға бағыры) — вид лососевых отряда лососеобразных. Распространён от Европы до Урала и Средней Азии. В Башкортостане обитает в реках восточного Лемеза, Наязы, Узян, Малый и Большой Кизил, Янгелька, Суран, Большой и Малый Сурюнзяк, Ик, Большой и Малый Апшак, Бетеря, Сув-якты, Мендым, Зиган, Зилим, Большой Кутюм, Кошелевка,Малый Сурень, Ямашла, Большой и Малый Иняк, Бердяш, Акаваз, Липовка, Яманелга.

Русская быстрянка (башк. Шаршы күкене) — вид карповых отряда карпообразных. Распространена от Франции до Урала. В Башкортостане обитает в реках Белая, Нугуш, Зилим, Инзер, БольшойИнзер, Лемеза, Сим, Уфа, Уршак, Юрюзань, Ик, Ашкадар.

Обыкновенный подкаменщик (башк. Зөгәй) — вид рогатковых отряда скорпенообразных. Распространён в реках и озёрах от Пиренеев до Урала. В Башкортостане отмечен по реке Белой от верховьев до города Мелеуз, а также по притокам рек Белая и Уфа, в верховьях реки Малый Инзер. Редко встречается в реке Юрюзань.

Сиг озера Банное (башк. Яҡтыкүл алабалығы) — вид отряда лососеобразных. Маточное стадо обитает только в озере Банное (Яктыкуль); используется в рыбоводных целях.

Синец (башк. Күкйөн) — вид отряда карпообразных. В Башкортостане редок. Встречен в реке Белая и пойменных озёрах от нижнего течения и до села Охлёбнино. Найден в реке Дёма.

Малая южная колюшка — вид отряда колюшкообразных. Обитает только в озере Банное (Яктыкуль).

Черноморская игла (башк. Ҡара диңгеҙ орсоғо) — вид отряда иглообразных. Случайный вселенец в озеро Асликуль. Встречен в Бельском участке Нижнекамского водохранилища.
Берш (башк. Берш) — вид отряда иглообразных. Заходит в низовья реки Белая из Нижнекамского водохранилища.